李广林

一、个人简介

李广林，男，博士（后），陕西师范老员工命科学学院教授，博士生导师，教育部新世纪优秀人才获得者。主要研究方向为生物信息学和功能基因组学，目前在《PNAS》、《Genes & Development》、《Frontier in Genetics》和《BMC Genomics》等期刊发表多篇研究论文。累计主持国家自然科学基金面上项目三项，参与国家自然科学重点项目一项。在教学方面主要从事本科生《生物信息学》、《生物统计学》和《表观遗传学》，以及研究生《生物信息学》和《生物信息学实验》等课程的教学工作。

二、主要研究领域及兴趣

1. miRNA、lncRNA以及circRNA等非编码RNA的识别、功能、作用机制与进化研究。目前兴趣集中于circRNA的研究，主要利用生物信息学方法进行circRNA识别工具的开发，利用生物化学、分子生物学以及遗传学等方法进行circRNA的功能与作用机制研究。

2. 萜类次生代谢调控的分子机理和进化，主要通过对生物信息学、生物化学、遗传学以及分子进化等方面理论和技术的整合，进行植物次生代谢调控的分子机理和进化研究。

3. 组学数据的整合研究，主要以基因组、转录组和代谢组学等方面的高通量数据为研究对象，利用生物信息学和系统生物学方面的方法和技术，开发组学数据整合分析相关的软件和算法。

三、代表性论文

1. Yin S, Tian X, Zhang J, Sun P, Li G*. PCirc: random forest-based plant circRNA identification software. BMC Bioinformatics. 2021,22(1):10.

2. Zhang J, Liu R, Zhu Y, Gong J, Yin S, Sun P, Feng H, Wang Q, Zhao S, Wang Z, Li G^*. Identification and characterization of circRNAs responsive to methyl jasmonate in Arabidopsis thaliana. Int J Mol Sci, 2020, 21(3):792.

3. Chen H, Köllner TG, Li G, Wei G, Chen X, Zeng D, Qian Q, Chen F. Combinatorial evolution of a terpene synthase gene cluster explains terpene variations in Oryza. Plant Physiol, 2020, 182(1):480-492.

4. Sun P, Li G^*. CircCode: A powerful tool for identifying circRNA coding ability. Front Genet, 2019, 10:981.

5. Tang B, Hao Z, Zhu Y, Zhang H, Li G^*. Genome-wide identification and functional analysis of circRNAs in Zea mays. PLoS One, 2018, 13(12):e0202375.

6. Jia Q, Li G, Kollner TG, Fu J, Chen X, Xiong W, Crandall-Stotler BJ，Bowman JL, Weston DJ, Zhang Y, Chen L, Xie Y, Li FW, Rothfels CJ, Larsson A, Graham SW, Stevenson DW, Wong GK, Gershenzon J, Chen F. Microbial-type terpene synthase genes occur widely in nonseed land plants, but not in seed plants. P Natl Acad Sci USA, 2016, 113(43):2328-12333.

7. Chen H^#, Li G^#, Kollner TG, Jia Q, Gershenzon J, Chen F. Positive Darwinian selection is a driving force for the diversification of terpenoid biosynthesis in the genus Oryza. BMC Plant Biol, 2014, 14:239.

8. Li G, Kollner TG, Yin Y, Jiang Y, Chen H, Xu Y, Gershenzon J, Pichersky E, Chen F. Nonseed plant Selaginella moellendorffii has both seed plant and microbial types of terpene synthases. P Natl Acad Sci USA, 2012, 109(36):14711-14715.