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姓名：黄蕾 |
职称/职务：副教授 硕士研究生导师 |
电话： |
传真： |
电子信箱：caspar@snnu.edu.cn |
研究方向：植物适应性进化与物种形成、进化基因组学、植物资源利用与活性成分开发 |
办公地点：格物楼3505 |
一、个人简介
长期从事植物系统发育、群体基因组学、分子进化等领域的研究，重点关注代表性植物类群的适应性进化、物种形成机制。近年来尝试将植物进化生物学的理论与方法引入传统的植物资源开发研究，革新种质库构建的常规方式，并结合社会需求，利用交叉学科的思想进行植物活性成分的创新性开发。
承担本科生教学工作，主讲专业基础课程《植物学》、《植物学实验》，并开设全校通识选修课程《趣论植物与健康》；多次指导员工参与全国老员工生命科学竞赛、全国老员工创新创业大赛校级项目；承担研究生教学工作，主讲专业选修课《基因组学前沿与应用》。目前出版通识选修课配套教材《植物与健康》、学术著作《中国黄花蒿野生资源的分布与调研》。
欢迎热爱植物科学的优秀学子加入我们，在解读植物奥秘之路上并肩同行！
教育经历
(1) 2009-12 至 2012-06, 中国科学院植物研究所, 植物学, 博士
(2) 2006-09 至 2009-12, 中国科学院植物研究所, 植物学, 硕士
(3) 2003-09 至 2006-06, 中国农业大学, 生物学, 学士
二、主要研究领域及兴趣
1. 以箭竹和黄花蒿等为代表，综合利用多组学手段阐明植物在小尺度水平的适应性进化和物种形成机制， 关注重要代谢途径的分子进化和群体动态。
2. 在科、属水平上开展重要植物类群的进化基因组学研究，探讨不同进化事件（如多倍化、水平基因转移）对基因组结构变异、快速适应性辐射、创新性状起源等的影响。
3. 开展药用植物、芳香植物的资源收集与种质库构建，并聚焦其活性成分的功能性开发。
三、承担的科研项目
1. 主持国家自然科学基金青年科学基金项目, 基于多个基因序列探讨华北耧斗菜复合体内无距性状的起源问题, 2018.1.1- 2020.12.31, 31700180 (项目批号)
2. 主持中国科学技术协会高端科技创新智库青年项目，中医药助力乡村振兴发展研究, 2021.12-2022.12, 2021ZZZLFZB1207132 (项目批号)
四、出版的著作
1. 《植物与健康》，2022，陕西科学技术出版社，独编
2. 《中国黄花蒿野生资源的分布与调研》，2022，陕西科学技术出版社，独著
五、代表性论文
(1) Huang L, Geng FD, Fan JJ, et al.. Evidence for two types of Aquilegia ecalcarata and its implications for adaptation to new environments. 2022, Plant Diversity 44:153-162.
(2) Huang L, Xing X-C, Li W-W, Zhou Y, Zhang Y-Q, Yi Ren, Kang J-Q. 2021. Population genetic structure of giant panda staple food Bamboo (Fargesia spathacea complex) and its taxonomic implications. Journal of Systematics and Evolution 59(5): 1051-1064. doi: 10.1111/jse.12594
(3) Huang L, Geng F-D, Xue C, Fan J-J, Zhang X-Y, Kang J-Q, Zhang J-Q, Ren Y. 2018. Genetic diversity and evolutionary history of four closely related Aquilegia species revealed by ten nuclear gene fragments. Journal of Systematics and Evolution 56(2): 129-138.
(4) Huang L, Du Y-S，Zheng X-M，Liu R，Zhou H-F, Ge S. 2013. Nucleotide diversity of 11S seed storage protein gene and its implications for ecological adaptation of Oryza nivara. Journal of Systematics and Evolution 51：641-651.
(5) 黄蕾，邢晓成，张雨曲等. 地理因素对箭竹复合体遗传多样性与遗传分化的影响. 2021.西北植物学报. 41(5): 0872-0879.
(6) Fang-Dong Geng, Jing-He Xie, Cheng Xue, Li Sun, Jiao-Jie Li, Chen-Yu Niu, Lei Huang, Xiao-Hui Zhang, Ju-Qing Kang, Hong-Zhi Kong, Yi Ren, and Jian-Qiang Zhang. Loss of innovative traits underlies multiple origins of Aquilegia ecalcarata 2022. Journal of Systematics and Evolution 60,1291-1302.
(7) Cheng Xue, Fang-Dong Geng, Jiao-Jie Li, Dan-Qing Zhang, Fei Gao, Lei Huang, Xiao-Hui Zhang, Ju-Qing Kang, Jian-Qiang Zhang, Yi Ren. Divergence in the Aquilegia ecalcarata complex is correlated with geography and climate oscillations: Evidence from plastid genome data. 2021 Molecular Ecology doi.org/10.1111/mec.16151
(8) Cai Z, Zhou L, Ren N-N, Xu X, Liu R, Huang L, Zheng X-M, et al. 2019. Parallel speciation of wild rice associated with habitat shifts. Molecular Biology and Evolution 36: 875–889.
(9) Xue C, Geng F-D, Zhang X-Y, Chang X-P, Kang J-Q, Huang L, Zhang J-Q, Ren Y. 2019. Pattern of variation in the morphological characteristics of Aquilegia ecalcarata and its closely related species. Journal of Systematics and Evolution (doi: 10.1111/jse.12494)
(10) Zhang YQ, Zhou Y, Hou XQ, Huang L, Kang JQ, Zhang JQ, Ren Y. 2019. Phylogeny of Fargesia (Poaceae: Bambusoideae) and infrageneric
adaptive divergence inferred from three cpDNA and nrITS sequence
data. Plant Systematics and Evolution 305:61–75
(11) Wang X-M, Feng L, Zhou T, Ruhsam M, Huang L, Hou X-Q, Sun X-J, Fan K, Huang M, Zhou Y, Song J. 2018. Genetic and chemical differentiation characterizes top-geoherb and non-top-geoherb areas in the TCM herb rhubarb. Scientific Reports 8: 9424.
(12) Guo J，Liu R，Huang L，Zheng X-M，Liu P-L，Du Y-S，Cai Z，Zhou L，Wei Xi-H, Zhang F-M，Ge Song. 2016. Widespread and adaptive alterations in genome-wide gene expression associated with ecological divergence of two Oryza species. Molecular Biology and Evolution 33（1）：62-78.
(13) Wang C-H，Zheng X-M，Xu Q，Yuan X-P，Huang L, Zhou H，Wei X-H, Ge S. 2014. Genetic diversity and classification of Oryza sativa with emphasis on Chinese rice germplasm. Heredity 112（5）：489-496.
(14) Xu X，Liu X，Ge S，Jensen JD，Hu F，Li X，Dong Y，Gutenkunst RN，Fang L，Huang L, Li JX，He WM，Zhang GJ，Zheng XM，Zhang FM，Li YR，Yu C，Kristiansen K，Zhang XQ，Wang J，Wright M，McCouch S，Nielsen R，Wang J, Wang W. 2012. Resequencing 50 accessions of cultivated and wild rice yields markers for identifying agronomically important genes. Nature Biotechnology 30（1）：105-111.
